HLADB-2.28.0-January 2010 HLA-DQB1 Protein Sequence Alignments Sequences Aligned: 15 January 2010 Steven G. E. Marsh, Anthony Nolan Research Institute. Prot. Pos. -40 -30 -20 -10 DQB1*050101 MS WKKSLRIPGD LRVATVTLML AILSSSLAEG DQB1*050102 ** ********** ********** ********** DQB1*050201 -- ---------- ---------- ---------- DQB1*050202 ** ********** ********** ********** DQB1*050301 ** ********** ********** ********** DQB1*050302 ** ********** ********** ********** DQB1*0504 ** ********** ********** ********** DQB1*0505 ** ********** ********** ********** DQB1*020101 -- ---A-----G --A------- SM--TPV--- DQB1*020102 ** ********** ********** ********** DQB1*0202 -- ---A-----G --A------- SM--TPV--- DQB1*0203 ** ********** ********** ********** DQB1*0204 ** ********** ********** ********** DQB1*0205 ** ********** ********** ********** DQB1*030101 -- ---A-----G --A------- -M--TPV--- DQB1*030102 ** ********** ********** ********** DQB1*030103 ** ********** ********** ********** DQB1*030104 ** ********** ********** ********** DQB1*030201 -- ---A-----G ---------- -M--TPV--- DQB1*030202 ** ********** ********** ********** DQB1*030203 ** ********** 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