HLA-DQB1 Protein Sequence Alignments IMGT/HLA Release: 3.1.0 Sequences Aligned: 16 July 2010 Steven GE Marsh, Anthony Nolan Research Institute. Please see http://hla.alleles.org/terms.html for terms of use. Prot -40 1 | | DQB1*05:01:01 MS WKKSLRIPGD LRVATVTLML AILSSSLAEG RDSPEDFVYQ FKGLCYFTNG TERVRGVTRH IYNREEYVRF DSDVGVYRAV TPQGRPVAEY DQB1*05:01:02 ** ********** ********** ********** ***------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- DQB1*05:02:01 -- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------S--- DQB1*05:02:02 ** ********** ********** ********** ********-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------S--- DQB1*05:03:01 ** ********** ********** ********** ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------D--- DQB1*05:03:02 ** ********** ********** ********** ********** ********** ---------- ---------- ---------- ------D--- DQB1*05:04 ** ********** ********** ********** ********-- ---------- ---------Y ---------- ---------- ------S--- DQB1*05:05 ** ********** ********** ********** *****----- ---------- ---------- -------A-- ---------- ------S--- DQB1*05:06 ** ********** ********** ********** *****----- 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DQB1*06:37 -K-------R T--EL-T--- ------F--- ----****** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DQB1*06:38 ---------R T--EL-T--- -----G---- ---------- ---------- -----V---- ----G----Q --Q------- ---------- ---------- DQB1*06:39 ---------R T--EL-T--- -----G---- ---------- ---------- -----V---- ----G----- ---------- ---------- ---------- DQB1*06:40 ---------- T--EL-T--- ------F--- ----****** ********** ********** ********** ********** ********** ********** Prot 161 | DQB1*05:01:01 LEMTPQRGDV YTCHVEHPSL QSPITVEWRA QSESAQSKML SGVGGFVLGL IFLGLGLIIR QRSRKG.... ....LLH DQB1*05:01:02 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* DQB1*05:02:01 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------.... ....--- DQB1*05:02:02 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* DQB1*05:03:01 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------PQGP PPAG--- 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