HLADB-2.28.0-January 2010 HLA-DPA1 Protein Sequence Alignments Sequences Aligned: 15 January 2010 Steven G. E. Marsh, Anthony Nolan Research Institute. Prot. Pos. -40 -30 -20 -10 DPA1*010301 M RPEDRMFHIR AVILRALSLA FLLSLRGAGA DPA1*010302 * ********** ********** ********** DPA1*010303 * ********** ********** ********** DPA1*010304 * ********** ********** ********** DPA1*0104 * ********** ********** ********** DPA1*0105 * ********** ********** ********** DPA1*010601 * ********** ********** ********** DPA1*010602 * ********** ********** ********** DPA1*0107 * ********** ********** ********** DPA1*0108 * ********** ********** ********** DPA1*0109 * ********** ********** ********** DPA1*0110 * ********** ********** ********** DPA1*020101 * ********** ********** ********** DPA1*020102 * ********** ********** ********** DPA1*020103 * ********** ********** ********** DPA1*020104 * ********** ********** ********** DPA1*020105 * ********** ********** ********** DPA1*020106 * ********** ********** ********** DPA1*020201 * ********** ********** ********** DPA1*020202 * ********** ********** ********** DPA1*020203 * ********** ********** ********** DPA1*0203 * ********** ********** ********** DPA1*0204 * ********** ********** ********** DPA1*0301 * ********** ********** ********** DPA1*0302 * ********** ********** ********** DPA1*0303 * ********** ********** ********** DPA1*0401 * ********** ********** ********** Prot. Pos. 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 DPA1*010301 IKADHVSTYA AFVQTHRPTG EFMFEFDEDE MFYVDLDKKE TVWHLEEFGQ AFSFEAQGGL ANIAILNNNL NTLIQRSNHT QATNDPPEVT VFPKEPVELG DPA1*010302 ********** ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*010303 ***------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*010304 ***------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0104 *********- ---------- -------D-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*0105 *********- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*010601 ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*010602 ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0107 ****------ ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0108 ***------- ---------- -------D-- ---------- ---------R ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0109 ***------- ---------- --T------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0110 ***------- ---------- ---------- ---------- --C------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*020101 ---------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- DPA1*020102 ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*020103 ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*020104 ********** ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*020105 ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*020106 ---------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A---**** ********** DPA1*020201 *******--- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- DPA1*020202 ***------- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- DPA1*020203 *****----- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*0203 ***------- ---------- ---------- ---------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** DPA1*0204 ***------- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- --------D- ---------- --A-****** ********** DPA1*0301 *********- M--------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----S---- ---------- ---------- ---------- DPA1*0302 ***------- M--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** DPA1*0303 ***------- M--------- -------D-- ---------- ---------- ---------- -----S---- ---------- ----****** ********** DPA1*0401 *********- -------T-- -------D-- ---------- ---------R ---------- ---------- -IA------- --A------- -----A---- Prot. Pos. 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 DPA1*010301 QPNTLICHID KFFPPVLNVT WLCNGELVTE GVAESLFLPR TDYSFHKFHY LTFVPSAEDF YDCRVEHWGL DQPLLKHWEA QEPIQMPETT ETVLCALGLV DPA1*010302 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*010303 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*010304 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0104 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*0105 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*010601 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*010602 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0107 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0108 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0109 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0110 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020101 ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*020102 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020103 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020104 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020105 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020106 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*020201 ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*020202 ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*020203 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0203 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0204 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0301 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- DPA1*0302 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0303 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** DPA1*0401 ---------- ---------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------A ---------- Prot. Pos. 210 220 230 DPA1*010301 LGLVGIIVGT VLIIKSLRSG HDPRAQGTL DPA1*010302 ********** ********** ********* DPA1*010303 ********** ********** ********* DPA1*010304 ********** ********** ********* DPA1*0104 ---------- ---------- --------- DPA1*0105 ********** ********** ********* DPA1*010601 ********** ********** ********* DPA1*010602 ********** ********** ********* DPA1*0107 ********** ********** ********* DPA1*0108 ********** ********** ********* DPA1*0109 ********** ********** ********* DPA1*0110 ********** ********** ********* DPA1*020101 ---------- ---------- -------P- DPA1*020102 ********** ********** ********* DPA1*020103 ********** ********** ********* DPA1*020104 ********** ********** ********* DPA1*020105 ********** ********** ********* DPA1*020106 ********** ********** ********* DPA1*020201 ---------- ---------- -------P- DPA1*020202 ---------- ---------- -------P- DPA1*020203 ********** ********** ********* DPA1*0203 ********** ********** ********* DPA1*0204 ********** ********** ********* DPA1*0301 ---------- ---------- --------- DPA1*0302 ********** ********** ********* DPA1*0303 ********** ********** ********* DPA1*0401 ---------- ---------- -------P-